Николай Коперник родился 19 февраля 1473 года в польском городе Торуни на Висле, крупном торговом центре, входившем в ганзейский союз.
Отец Коперника, уроженец Кракова (тогдашней столицы Польши), задолго до рождения сына Николая переселился в Торунь и занимал видное положение в купеческих кругах города. После смерти отца десятилетнего мальчика взял на воспитание его дядя со стороны матери, Лука Ваченрод, ставший впоследствии епископом Вармийской епархии, одной из составных частей будущей Восточной Пруссии. Коперник получил хорошее образование и девятнадцати лет (в 1492 г.,— в год открытия Америки Колумбом) в числе шестидесяти девяти вновь принятых студентов поступил в Краковский университет. В то время в круг наук, изучаемых в университете, входили богословие, юриспруденция и медицина, сдобренные аристотелевской философией. Преподавание велось на латинском языке, который Коперник основательно изучил еще в Торуни. Позже он изучил греческий язык. Помимо этих обязательных предметов в Краковском университете были хорошо представлены математические дисциплины. Математику и астрономию преподавал выдающийся педагог и лектор Брудзевский. От него Коперник получил основательные знания геоцентрической системы мира Птолемея. В 1496 году, желая продолжить свое образование, Коперник поехал в Италию, где поступил в Болонский университет.